Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms