Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp48Q3V0C5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Usp48Q3V0C5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp48Q3V0C5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp48Q3V0C5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms