Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms