Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9Q3V038 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms