Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D130052B06RikQ3UW13 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D130052B06RikQ3UW13 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D130052B06RikQ3UW13 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D130052B06RikQ3UW13 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D130052B06RikQ3UW13 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D130052B06RikQ3UW13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D130052B06RikQ3UW13 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D130052B06RikQ3UW13 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D130052B06RikQ3UW13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D130052B06RikQ3UW13 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D130052B06RikQ3UW13 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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D130052B06RikQ3UW13 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms