Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms