Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms