Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms