Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc33Q3ULW6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms