Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b2Q3UJB0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms