Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc34Q3UI66 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms