Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX0

Nol8, Nucleolar protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol8Q3UHX0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol8Q3UHX0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms