Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrrc58Q3UGP9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms