Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms