Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3W5

Prmt9, Protein arginine N-methyltransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt9Q3U3W5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prmt9Q3U3W5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms