Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud5Q3U2S4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Otud5Q3U2S4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Otud5Q3U2S4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Otud5Q3U2S4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Otud5Q3U2S4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Otud5Q3U2S4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Otud5Q3U2S4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud5Q3U2S4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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