Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl4Q3TZA2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms