Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hhla1Q3TYV2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hhla1Q3TYV2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms