Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms