Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TchpQ3TVW5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms