Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc136Q3TVA9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms