Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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