Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms