Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca4Q3TKT4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms