Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shroom4Q1W617 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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Shroom4Q1W617 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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Shroom4Q1W617 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shroom4Q1W617 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
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