Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms