Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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