Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fgfbp3Q1HCM0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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