Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms