Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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