Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf3ip1Q149C2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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