Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spatc1Q148B6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Spatc1Q148B6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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