Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc162pQ0VG85 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms