Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne7Q0VE82 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms