Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ssrp1Q08943 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms