Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SctQ08535 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SctQ08535 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SctQ08535 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SctQ08535 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SctQ08535 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SctQ08535 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SctQ08535 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SctQ08535 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SctQ08535 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SctQ08535 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SctQ08535 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SctQ08535 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms