Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms