Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms