Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprgQ05909 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms