Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Thbs3Q05895 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Thbs3Q05895 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Thbs3Q05895 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Thbs3Q05895 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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