Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox10Q04888 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms