Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnb1Q03717 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms