Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms