Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms