Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp11Q02853 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp11Q02853 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms