Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms