Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GscQ02591 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GscQ02591 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GscQ02591 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms