Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms