Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ascl1Q02067 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms