Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms